- 研究所の統括、研究の計画、支援など
- 保健、環境科学全般
産業技術センター
（応用化学研究部・繊維研究部・技術支援部・食品研究部）
- 無機材料、高分子材料、複合材料、バイオ、生化学、デザイン、メカトロニクス、製造加工（紡績、撚糸織物、ニット、染色、縫製、アパレル、不織布）、畜産加工、水産加工、野菜・果実加工、穀類加工、醸造、寒天製造
- パルプ製造業、紙製造業、加工紙製造業、紙製品製造業、紙製容器製造業
- 電気・電子、ソフトウェア・情報処理
- 陶磁器製造業、耐火物製造業、瓦製造業、ファインセラミックス、窯業原料
- 複合材料、木質系材料、住環境、福祉用具、ユニバーサルデザイン、人間生活工学
- 作物・野菜・果樹・花き・茶の品種改良及び栽培技術、病害虫防除技術
- 農学（作物・野菜・花き・果樹の育種及び栽培試験）
- 農業（水稲・野菜・花き・果樹の育種及び栽培試験）
- 先端育種、昆虫機能（蚕糸技術を含む）、微生物機能
- 和牛のゲノム解析、受精卵移植新技術開発と確立、飛騨牛の育種改良、種雄牛の産肉能力検定、凍結精液精算・配布、和牛生産・管理技術、草地・放牧試験、飼料生産技術確立、技術普及・指導
- 受精卵移植による乳牛の改良、飼料分析、飼養管理技術、飼料生産・調整技術、技術普及・指導
- 豚の系統造成と維持、豚ゲノム解析、飼養管理技術、精液配布、畜産の環境保全・リサイクル、飼料品質改善、技術普及・指導
- 卵用・肉用鶏の育種改良、奥美濃古地鶏の改良・種鶏供給、飼養管理技術、環境保全、技術普及・指導
- 水産学（養殖技術、育種、量産化、病害、種苗生産）
- 希少水生生物（温水性魚類、冷水性魚類；繁殖、環境、生態）
- 造林、病害虫、防災、製材機械、特用林産、育林技術
- 音楽療法の研究と普及（教育、健康、福祉、医療）
- バイオテクノロジー（医療、健康、環境改善）
